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10 May 2011

Step in breakdown of HIV proteins essential to recognition, destruction of infected cells

A key step in the processing of HIV within cells appears to affect how effectively the immune system's killer T cells can recognize and destroy infected cells. Researchers at the Ragon Institute of MGH, MIT and Harvard have found that – as HIV proteins are broken down within cells, a process that should lead to labeling infected cell for destruction by CD8 T cells – there is a great variability in the stability of resulting protein segments, variations that could significantly change how well cells are recognized by the immune system. Their report appears in the June Journal of Clinical Investigation. "We have identified a novel mechanism by which HIV escapes recognition by virus-specific cytotoxic T cells, says Sylvie Le Gall, PhD, of the Ragon Institute, the paper's senior author. "This discovery may help us better understand the immune-system failure that characterizes HIV infection and provide information critical to the successful development of immune-system-based therapies."
CD8 T cells that have been programmed to target and destroy HIV-infected cells recognize those cells through tiny bits of viral protein, called peptides, displayed on the cell surface. Details of how HIV proteins are broken down into peptides and loaded onto the specialized molecules, called MHC Class I, that carry them to the cell surface are not well understood. Also unknown is whether particular HIV peptides are more effective than others in flagging cells for destruction.
Le Gall and her team first discovered that HIV peptides reduced to a length of 8 to 11 amino acids within infected cells varied greatly in their stability, with some breaking down further within seconds and others remaining unchanged for nearly an hour. Collaborators David Heckerman, MD, PhD, and Carl Kadie from Microsoft Research analyzed the biochemical features of 166 HIV peptides and identified particular structural patterns associated with either stability or instability. The researchers then showed that substituting a stability-associated structural motif for an instability motif significantly increased peptide stability, and vice-versa.
The stability of a peptide within the cell can significantly affect how much peptide is available to be loaded onto MHC Class I molecules and displayed on the cell surface. The authors found that several known HIV mutations significantly reduced peptide stability – one common mutation virtually abolished the cell-killing action of CD8 T cells. The Microsoft team members have developed a model to predict the probable stability of specific HIV peptides, but more research is needed to determine how variations in stability affect the presentation of the peptide segments called epitopes to CD8 cells and whether changes in peptide stability lead to a more efficient immune response.
"Efforts to develop T-cell-based vaccines need to focus on producing epitopes that elicit the most protective response," says Le Gall, an assistant professor of Medicine at Harvard Medical School. "Modulating peptide stability offers a unique way of regulating epitope presentation in favor of producing the most effective defence against HIV."

**Source: Massachusetts General Hospital

Blood test for colon cancer screening beneficial for some seniors, but not for many others

A new study of U.S. veterans ages 70 and older finds that the healthiest get the most benefit from current colon cancer screening methods. However, for many less healthy veterans the burdens of screening may outweigh the benefits. "This study shows that we really need to target screening in older adults, so that those who will benefit do get screened and followed-up while those who won't benefit aren't exposed to unnecessary burdens," said Christine E. Kistler, MD, assistant professor of Family Medicine at the University of North Carolina at Chapel Hill and lead author of the study.
The study was published online on May 9, 2011, by the journal Archives of Internal Medicine. Kistler led the study while completing a geriatrics fellowship at the University of California, San Francisco and the San Francisco Veterans Affairs Medical Center. She has since joined the faculty at the UNC School of Medicine.
In the study, 212 patients ages 70 and older who were treated at four Veterans Affairs medical facilities were followed for 7 years after receiving a positive result in a fecal occult blood test (FOBT). The test, which determines whether or not occult (hidden) blood is present in the stool, is the most common method used in the VA health system as an initial screen for colon cancer. A follow-up colonoscopy within one year is recommended for patients with a positive FOBT.
The study found that a little more than half of the patients received a follow-up colonoscopy. Among those who did, more than 25 percent were found to have significant disease such as precancerous adenomas or cancer, were treated, and survived for more than five years. However, 59 percent of those who received follow-up colonoscopy did not have cancer, 16 percent died of other causes within 5 years, and 10 percent suffered complications from either colonoscopy or cancer treatment.
Among those who did not receive follow-up colonoscopy, nearly half died of other causes within five years of their positive FOBT. Four patients ultimately died of colon cancer -- three within the first 5 years of their positive FOBT.
Of the 212 patients in the study, the researchers defined 33 patients, a little more than 15 percent, as receiving a net benefit from their positive FOBT. Another 30 patients, about 14 percent, were defined as receiving indeterminate benefit. The remaining 149 patients, about 70 percent, were defined as receiving a net burden from colorectal cancer screening.
Kistler said there was "a spectrum of burden" among those in the net burden group. For some the burden was that they never received a follow-up colonoscopy. Others received a colonoscopy but it found no evidence of cancer, and some died of causes other than colon cancer. In each of these examples, the patients received no benefit as a result of their positive FOBT, Kistler said.
"This study shows that we need to do a better job of targeting colon cancer screening to those seniors who are healthy and functional and are likely to benefit. At the same time, this study also shows that we need to seriously examine why those seniors who are not likely to benefit are being subjected to colon cancer screening," Kistler said.

**Source: University of North Carolina School of Medicine

Ana González-Angulo a EL PAIS: "A este paso cada cáncer de mama será como una enfermedad rara"



Cuando Ana González-Angulo habla de cáncer de mama -ella, nacida en Popayán, Colombia, en 1971, dice "de seno"- se tiene la impresión de que está exponiendo un juego de muñecas rusas. O que está manejando las palabras y las definiciones con la finura de quien utiliza un bisturí. Este tipo de tumor, el más frecuente entre las mujeres del mundo (más de 1,5 millones al año; en España, unas 16.000), ha sido diseccionado hasta tal extremo que González-Angulo no duda en decir que "a este paso, dentro de unos años, cada subtipo será como una enfermedad rara".

La oncóloga, que lleva en el MD Anderson de Houston (Tejas) desde 2003, no dice rara en el sentido coloquial, de poco frecuente. Se refiere a que según se van haciendo subdivisiones, cada una tiene menos incidencia (se considera que una enfermedad es rara cuando la padecen menos de una de cada 2.000 personas). "En la práctica clínica hay tres grandes grupos de tumores", explica González-Angulo: "Los que se pueden tratar con herceptin o no, los susceptibles de recibir terapia endocrina y los que solo responden a la quimioterapia", aclara.
Pero, en verdad, la investigadora se refiere a cuatro grupos, porque hay un 15% de los tumores que no responde a ninguno de estos tratamientos, a pesar de que la decisión de quién recibe qué tratamiento "está ya muy estandarizada y se hace por una muestra patológica en todo el mundo".
Por cada tratamiento que surge contra el cáncer de mama -uno de los más investigados por su elevado impacto-, aparece un subtipo que es resistente. Y según se investiga, las divisiones aumentan: "Ese 15% que no responde a los tratamientos se puede dividir ya en seis categorías. Por eso es tan difícil tratarlo", afirma González-Angulo. Por eso, casi como pidiendo perdón, ella dice que se dedica a "lo más feo".
Dentro de este grupo de tumores que tienen peor diagnóstico, Gónzález-Angulo trabaja ahora en los más recónditos. "Es el artículo que todavía no he escrito, pero que será el más importante de mi carrera", vaticina.
El trabajo se centra en un subtipo de cáncer de mama (casi habría que decir subsubtipo o incluso descender más aún en las ramificaciones de un tumor que se complica cada vez más) que tiene como características ser HER2 negativo (es decir, no tiene esos receptores), con receptores hormonales positivos y con ganglios afectados. La novedad es que los investigadores del MD Anderson de Tejas han desarrollado "un método numérico para intentar predecir qué tipo de tratamiento hay que darles". "Lo estándar es darles quimioterapia, pero hay un grupo de pacientes a las que, aparte de darles toxicidad, este tratamiento no les ayuda nada", explica la investigadora.
Este sistema debe servir para decidir si esa terapia tan agresiva compensa o no. Se trata de lo que los científicos llaman el examen Oncotype DX, una especie de medidor que ya se usa de manera sistemática en Estados Unidos y del que la filial española de la MD Anderson acaba de presentar el primer ensayo en Europa, firmado por Antonio González-Martín.
Este aparato hace un primer trabajo: "Mide 21 genes, su presencia, copias y mutaciones. A cada uno de ellos se le da un peso, y con el valor total se obtiene una cifra del 1 al 100 que se quiere demostrar que sirve para vaticinar qué mujeres tendrán una metástasis por primera vez", afirma González-Angulo. Ese es el indicador para decidir si "existe riesgo de que haya recaída", dice la investigadora. Si el número (el peso) que se obtiene es alto, también lo es el peligro; si es bajo, no.
Para demostrarlo, en un proyecto en el que se espera contar con participación española (el Grupo Español de Investigación en Cáncer de Mama está interesado) se van a estudiar 9.400 mujeres, de las que 4.000 serán tratadas, 2.000 con terapia estándar (hormonal más quimioterapia) y a otras 2.000 se les quitará la quimioterapia. "Lo que queremos demostrar es que si el índice es menor de 25, la quimio no beneficia", y ver "a partir de qué puntuación hay que usarla", afirma. El resultado que ella espera es que en este tipo de tumores se pueda quitar "la quimioterapia en el 70% de los casos, con lo que se eliminaría la toxicidad para las mujeres, y los costes del tratamiento". O, como dice para resumir porque entiende que se trata de algo muy complejo, cómo "a partir de datos genéticos se puede identificar mejor a las pacientes para ofrecerles el tratamiento con menores riesgos".
La investigadora no cree que conseguir voluntarias sea un problema. Aunque hay que ofrecerles un tratamiento que no es el estándar, "muchas estás dispuestas con tal de evitar la quimioterapia", afirma






**Publicado en "EL PAIS"

Los niños que toman leche materna se portan mejor según un estudio

Al debate permanente sobre la lactancia materna -sobre la duración de la misma y sus beneficios para el bebé- se suma ahora otro tema de discusión: unos investigadores británicos afirman que este tipo de alimentación influye en el posterior comportamiento del niño. Según este nuevo trabajo, quienes han tomado el pecho durante al menos cuatro meses tienen menos problemas de actitud que aquellos que son alimentados con leche artificial. Y la relación es independiente de otros factores como la edad de la madre o el nivel socioeconómico.
Aunque ya se habían realizado algunos estudios previos que habían apuntado este vínculo, ninguno era demasiado concluyente. Para establecer o no definitivamente esta relación, un equipo de investigadores de las Universidades de Oxford, Essex, York y del University College London (todas en el Reino Unido) analizó una muestra suficientemente amplia como para salir de dudas. Contaron con la participación de 10.037 madres e hijos, de los cuales 512 fueron prematuros. Tan sólo el 29% de los que vinieron al mundo a tiempo y el 21% de los prematuros fueron amamantados durante cuatro o más meses.
Cuando los niños cumplieron cinco años les sometieron a un cuestionario estándar para evaluar cómo se portaban. Sus resultados, que pubica la revista 'Archives of Disease in Childhood', muestran que los pequeños que se habían alimentado con leche artificial tenían más problemas de comportamiento como ansiedad o hiperactividad, mentían más y tenían peor relación con los padres que los que tomaron leche materna al menos cuatro meses. La proporción fue de un 16% de niños 'problemáticos' en el grupo de la leche artificial frente al 6% en el de la lactancia.
Aunque las causas de estas diferencias no están claras, los autores indican que podría deberse a que "la leche materna contiene muchas cantidades de ácidos grasos poliinsaturados esenciales, factores de crecimiento y hormonas que juegan un importante papel en el desarrollo del cerebro y del sistema nervioso central". Hasta hace una década las fórmulas lácteas infantiles no contenían estos ingredientes. Añadirles suplementos con ácidos grasos es relativamente reciente y aún no se sabe a ciencia cierta su eficacia.
Otra posible explicación que señalan los investigadores es que "el acto de amamantar crea una relación especial entre la madre y su bebé, mayor interacción entre ambos que puede influir en la posterior actitud del niño".
La relación sólo es significativa en los niños que no son prematuros y siempre que hayan tomado el pecho cuatro o más meses. "Nuestro trabajo refuerza la idea de que el tiempo de amamantamiento es uno de los factores que más influyen en las posibles repercusiones favorables para el niño".

**Publicado en "EL MUNDO"

Un equipo de la Universidad de Oviedo identifica una forma de progeria tras secuenciar el genoma en dos pacientes





Nacieron como dos bebés sanos y fuertes, pero a los dos años su cuerpo empezó a envejecer de forma acelerada. Con diez años, Néstor y Guillermo ya eran dos niños-viejos: se quedaron sin pelo, su piel se arrugó, apenas crecían y sus huesos empezaron a debilitarse como los de un sexagenario. Su diagnóstico parecía claro, padecían progeria, una extraña enfermedad que causa el envejecimiento prematuro en plena infancia y sitúa la esperanza media de vida en 15 años. Bajo este paraguas se agrupan diferentes trastornos hereditarios de los que se conocen algunos genes implicados. Ahora una investigación, realizada por el equipo de Carlos López-Otín de la Universidad de Oviedo, ha desvelado que el mal de Néstor y Guillermo es una nueva forma de progeria que permite a sus afectados disfrutar de una esperanza de vida mayor. El origen de la enfermedad está en un gen mutado, diferente a los identificados hasta la fecha. El hallazgo de este nuevo trastorno en dos familias españolas se publica hoy en la revista científica «American Journal of Human Genetics».
La investigación es la primera de este tipo llevada a cabo en nuestro país y proporciona nuevas claves acerca de los mecanismos moleculares del envejecimiento humano. Además del grupo de López-Otín han participado investigadores del Instituto de Medicina Oncológica y Molecular de Asturias.
El trastorno identificado provoca un envejecimiento precoz en la infancia, pero permite tener una supervivencia mayor porque no desencadena graves enfermedades cardiovasculares (infartos o ictus) que suelen acabar con la vida de los afectados. Hoy Néstor y Guillermo han superado los 20 y 30 años de edad. «Son los primeros pacientes cuya enfermedad ha podido ser identificada molecularmente a través de la secuenciación de su genoma sin precisar de otra información», explicó López-Otín.






-Genoma secuenciado
Para tratar de identificar la alteración genética responsable de esta nueva enfermedad, los investigadores secuenciaron el genoma de uno de los pacientes y el de sus padres. El estudio permitió descubrir la mutación en un gen denominado BANF1, que hasta el momento no se había descrito como responsable de ninguna enfermedad. La misma mutación se halló en la segunda familia estudiada.
El estudio también demuestra que basta con introducir el gen sano en las células aisladas de estos pacientes para corregir la enfermedad, al menos en el laboratorio. En la vida real, corregir el problema no es tan sencillo. López-Otín advierte que estamos ante «un primer paso» y confía en que este hallazgo permita en un futuro disponer de algún tratamiento que ponga freno a ese envejecimiento tan acelerado.






**Publicado en "ABC"

Unas 40.000 personas padecen lupus en España, en su mayoría mujeres jóvenes en edad fértil

En torno a 40.000 personas padecen lupus en España, en su mayoría mujeres jóvenes en edad fértil. De hecho, la proporción de afectados es de un hombre por cada diez mujeres y la mayoría de los casos aparece entre los 17 y 35 años, según datos del estudio EPISER realizado por la Sociedad Española de Reumatología (SER).
Con motivo del Día Mundial del Lupus, que se celebra este martes, 10 de mayo, la SER recuerda que se trata de una enfermedad autoinmune crónica que provoca que el sistema inmune comience a atacar a los tejidos propios, creando un exceso de anticuerpos anómalos en el torrente sanguíneo y causando inflamación y daños en las articulaciones, los músculos y en diferentes órganos.
"Esto pone en riesgo la vida del paciente, ya que puede afectar a cualquier órgano vital, incluyendo el corazón, los pulmones, los riñones o el cerebro", han advertido desde la SER. Aunque su causa se desconoce, sí se sabe que existen factores genéticos, ambientales y hormonales implicados en esta enfermedad.
Entre las manifestaciones clínicas más frecuentes se pueden destacar las del aparato locomotor (dolor e inflamación de las articulaciones), el cansancio, la fiebre, la pérdida de apetito y de peso, la disminución del número de glóbulos blancos, rojos y plaquetas, manchas en el dorso de la nariz y en las mejillas y alteraciones renales, entre otras.
Para abordar esta enfermedad, en España se ha puesto en marcha el primer registro científico multicéntrico de pacientes que se lleva a cabo a nivel nacional (RELESSER), con el objetivo de obtener datos "fidedignos y representativos" y poder desarrollar diferentes estudios prospectivos que permitan perfeccionar el conocimiento sobre el lupus y mejorar la atención de los pacientes. Por su parte, los expertos insisten en la necesidad de un abordaje precoz para que los afectados respondan de forma positiva a los tratamientos.

Un estudio confirma una mayor supervivencia a los afectados de mieloma múltiple con el tratamiento de Revlimid



Celgene International Sàrl ha anunciado que un estudio intergrupal de FASE III (CALGB 100104) confirma beneficios globales de supervivencia con Revlimid (lenalidomida) como terapia continua para pacientes con mieloma múltiple. Los datos actualizados de dicho estudio, patrocinado por el Instituto Nacional del Cáncer, fueron presentados por parte de representantes de una red de investigadores encabezada por el Grupo B de Cáncer y Leucemia (CALGB) en el Taller Internacional del Mieloma 2011 celebrado en París. A fecha de abril de 2011, los pacientes que recibieron Revlimid de manera continuada tras el transplante autólogo de células madre (ASCT) demostraron una mejora estadísticamente significativa en la tasa de supervivencia global (SG), que ascendió al 90 por ciento (209/231) en comparación al 83 por ciento(190/229) obtenido en pacientes objetos de aleatorización que recibieron placebo, a pesar de que casi el 80 por ciento (86/110) de los pacientes variaron el tratamiento para recibir lenalidomida de manera continuada en el momento de la conversión del estudio en no ciego.






Por otra parte, análisis adicionales presentados por CALGB sobre los datos originales de SG en el momento de la conversión del estudio en no ciego, demostraron una tasa de SG del 94 por ciento (218/231) en la rama de tratamiento continuado con Revlimid en comparación al 89 por ciento (204/229) en la rama de placebo. El tiempo medio de avance (TMA) fue significativamente superior en la rama de lenalidomida, situándose en 42 meses frente al TMA promedio de 30,9 meses registrado en la rama de placebo. En análisis de subgrupo respectivamente definidos, el TMA significativamente superior en todos los subgrupos de pacientes que recibieron tratamiento con lenalidomida tras ASCT. Dentro de dichos subgrupos el TMA fue el más largo en el grupo de pacientes que recibió lenalidomida tanto como terapia de inducción como terapia continuada tras ASCT.






En este estudio controlado, doble ciego, multicentro de Fase III, los pacientes con nuevo diagnóstico de mieloma múltiple que lograron al menos la estabilidad de la enfermedad (EE) tras el ASCT fueron objeto de aleatorización para recibir tratamiento diario continuado con 10mg de lenalidomida (n=231) o placebo (n=229) hasta la recaída. El Comité Independiente de Supervisión de Datos informa que un análisis provisional previsto en noviembre de 2009 ocasionó el anuncio de que el estudio había cumplido su fase de finalización principal y fue posteriormente convertido en no ciego. Los datos proceden del análisis continuado de los sujetos tras la conversión en no ciego hasta abril de 2011.



Los eventos adversos más comunes de grado 3-4 sufridos por los pacientes que recibieron lenalidomida o placebo fueron neutropenia, trombocitopenia e infecciones. Se observó un aumento en segundas malignidades primarias (SMP), fundamentalmente malignidades hematológicas, en pacientes que recibieron lenalidomida en comparación a pacientes que recibieron placebo. No obstante, un análisis de supervivencia libre de eventos, en el cual las SPM fueron incluidas como evento además de la muerte y el avance de la enfermedad, demostró que no hubo impacto significativo de las SPM en los beneficios de TMA y SG observados

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